生物信息学分析
Bioinformatics analysis
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实例分析

肝脏线粒体功能的系统蛋白质组学研究

基本信息
        材料:肝脏                                                                     主要技术:SWATH蛋白质组,LC-MS代谢组,基因芯片
        期刊: Science                                                                影响因子:37.205

 

文章摘要
        过去的二十年中,在“组学”技术不断驱使下,确定遗传学,分子通路以及整体表型之间关系的分析能力越来越强大。然而尽管取得了上述进展,影响复杂性状的大多数遗传因素仍不清楚。文章以肝脏线粒体复杂分子复合物装配为例,作为电子传递链中的一个重要组成部分,目前对此的认识极为有限。为探究复杂性状下的分子机制,文章联合转录组,蛋白质组,代谢组以及各组学之间的数据综合分析。80组共386只不同性状的BXD小鼠的研究共检测到25136条转录本,2622种蛋白,981种代谢物。在检测到的2600中转录-蛋白对中,85%有定量信息的性状位点是由转录组学或蛋白质组学检测得到;基因型和性状之间的复杂关联通过多组学数据综合构建。
方法流程

 

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        最新的质谱技术扩大了蛋白质组学和代谢组学测量的范围和可靠性。这些工具现在能够识别成千上万不同的因素驱动的分子途径,机制,以及由此产生的表型,从而大大有助于理解复杂系统。另外通过多层面的组学研究更有利于揭示基因型和性状之间的复杂关系,单一组学研究具终有局限性。另外,文章中最突出部分在于数据整合与分析。分析结果完整,新颖,可信度高。以上是文章能够获得高分的主要因素。

文献来源
        Evan G. Williams. et al., Systems proteomics of liver mitochondria function. 2016, Science.