LC-MS全代谢组
LC-MS Metabonomics
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实例分析

冠状动脉疾病综合代谢组学特征分析

基本信息

材料:冠心病患者血清                             主要技术:LC-MS全代谢组、靶向代谢组

期刊: J. Am. Coll. Cardiol                      影响因子:19.896

 

文章摘要

对来自四个中心的2324名疑似冠状动脉疾病(CAD)患者进行造影检查,分组如下:正常冠状动脉(NCA),非梗阻冠状动脉粥样硬化(NOCA),稳定型心绞痛(SA),不稳定型心绞痛(UA)和急性心肌梗塞(AMI)。通过LC-Q-TOF-MS分析代谢图谱并进行分析。通过对CAD样本的交叉验证比较,共鉴定了89种差异代谢产物。改变的代谢途径包括降低的磷脂分解代谢,增加氨基酸代谢,增加短链酰基肉碱,减少三羧酸循环,以及减少初级胆汁酸的生物合成。作者还发现12个生物标志物AUC值可达0.938至0.996(n = 1,086),在测试阶段预测值为89.2%至96.0%(n = 933),外部集也达到85.3%到96.4%(n = 305)。

 

方法流程

1、CAD患者

 

2、血浆收集

 

3、LC-MS分析

 

4、差异代谢物

 

5、OPLS-DA统计分析

 

6、代谢通路富集

 

7、代谢产物及相关性分析

 

8、诊断标志物

 

9、ROC曲线及外部测试

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代谢组是寻找生物标志物最常用的手段之一,但目前大多数代谢产物生物标志物还不足以取代现有的临床测试,一方面,疾病阶段的复杂性使大多数代谢产物的预测结果受到影响,另一方面,重复性不佳而导致生物标志物的灵敏性和特异性减弱。本文通过对冠心动脉疾病的不同分组及交叉验证确定了代谢标志物,并利用来源不同的样本进行验证,保证了代谢产物标志物的灵敏性、特异性及可重复性,值得临床研究的借鉴。

 

文献来源

Fan Y et al. Comprehensive Metabolomic Characterization of Coronary Artery Diseases. 2016, J. Am. Coll. Cardiol.