靶向蛋白组学
Targeted proteomics

靶向蛋白质组学针对性地分析复杂样品中的特定肽段,既可以判断肽段或蛋白在样品中的有无(前提是信号高于检测限),又可以对不同样品种的肽段或蛋白进行定量,用于表达差异比较。靶向蛋白质组学可以看做是新一代基于质谱的western blot技术,但是比传统的WB更准确,且不需要抗体。我们一般是基于Orbitrap质谱仪进行分析。

 

该方法的采集目标是由目标蛋白酶解得到的肽段,因此选取目标肽段和合适的采集方法很重要。如果您有意向做靶向蛋白质组学但是又不了解该如何做,请详询我们的技术支持。

产品介绍
The service content
  • L-WB(PRM技术)靶向蛋白组学
实例分析

靶向蛋白质组学在子宫内膜癌液体活检诊断中的应用

基本信息
材料:子宫分泌物                                                                             主要技术:PRM
期刊:Clin. Cancer Res.                                                                    影响因子:9.619

 

文章摘要
子宫内膜癌(EC)是第四大女性癌症,目前发病率和死亡率也在逐年上升。现行的诊断手段都是基于组织病理学,漏检率达22%,有50%病人的癌症组织分型和级别被错诊。基于这种现状,文章意图通过液体活检检测蛋白标志物的方式得到一个更加准确的诊断方法。通过LC-PRM技术对子宫吸出液体的52个蛋白含量进行测定,在EC组和对照组以及EC亚型组运用逻辑回归模型对数据进行处理,结果显示MMP9和KPYM,2蛋白组合,能够有效诊断EC AUC值为0.96,CTNB1,XPO2和CAPG,3蛋白组合,能够有效的区分各亚型,AUC值为0.99。该研究为临床诊断提供了非常好的候选标志物。

 

方法流程

 

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文章是典型的靶向蛋白质组研究案例。在研究分子标志物领域,PRM(靶向蛋白质组学技术)有着非常好应用前景,因为稳定性,灵敏度和通量高等特点,PRM正慢慢成为一种趋势。文中就检测候选蛋白数达52种,受检病例达116例(最终确定分子标志物所需的病例数需要更多),常规方法耗时耗力,数据质量不一定高。文章思路清晰简单:PRM靶向定量--Elisa确证--数据分析--确定特征性蛋白质组合。大样本配合现行主流技术再加上有效的临床效果使得文章能够得到高分。

 

文献来源
Elena Martinez-Garcia . et al., Targeted proteomics identifies proteomic signatures in liquid-biopsies of the endometrium to diagnose endometrial cancer and assist in the prediction of the optimal surgical treatment. 2017, Clin. Cancer Res.

L-WB技术是鹿明生物开发的以质谱平行反应监测技术(PRM)为核心,集成样品特殊处理及分析的一项蛋白精准定量技术。该技术具有特异性强、准确性高等特点,能够批量进行蛋白分析,是进行蛋白精准定量的理想技术。