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蛋白组学发展

 

随着质谱仪器的不断更新换代,蛋白组学的技术也不断的革新,从最早的2-D电泳技术到基于LC-MSMS的蛋白定性;从Labelfree 技术到标记定量iTRAQ/TMT技术以及时下备受推崇的DIA/SWATH技术、PRM/MRM技术,每一次的技术革新都使得蛋白组学研究更上一阶。

标记定量热门技术

 

1.  iTRAQ/TMT技术

当下蛋白组学研究中应用最广泛的技术是同位素标记定量(iTRAQ/TMT技术)。iTRAQ/TMT技术是利用DDA扫描模式,其扫描的方式是将一级质谱信号最强的Top 20的多肽进行二级打碎,然后进入二级质谱进行检测。其优势是二级谱图采集的肽段信息都来源于同一条多肽,有利于后续的定性分析;但是对于大样本量的组学实验,iTRAQ/TMT技术也存在一定的通量限制。在这样的需求下,DIA隆重登场。

 

2.DIA技术

DIA技术是先利用常规DDA质谱检测技术分析建立图谱库,之后采用DIA方法进行质谱数据采集,从而实现对样品中蛋白质的定性及定量,不同于传统的DDA技术,DIA技术将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,高速、循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测,因此可以无遗漏地获得样本中所有离子的全部碎片信息,数据利用度大大提高,缺失值更少。因此,DIA技术更适合于大样本量、复杂体系的蛋白检测。

 

3.PRM技术

 

蛋白验证对于蛋白组学研究来说也是一大难题,以往总是要用抗体去验证蛋白,但是由于抗体的定制难度,在非模式物种中的应用一直无法进行。那有没有一个技术不需要蛋白抗体就能验证蛋白呢?有的,PRM技术。

 

PRM:平行反应监测(Parallel Reaction Monitoring) 是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术,能够对目标蛋白质、目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段进行绝对定量,因此也被称之为基于液相色谱质谱联用技术的Western Blot(LC-MSMS based Western Blot, L-WB)。PRM技术基于Q-Orbitrap为代表的高分辨、高精度质谱平台(MRM技术基于SCIEX QQQ 系列质谱,以SCIEX-6500为代表),首先利用四级杆质量分析器的选择能力,用Q1选择目标肽段的母离子,随后在Collision cell 中对母离子进行碎裂, 最后利用Orbitrap分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。

 

应用方法

 

如何应用蛋白质组学技术来解决我们研究课题中实际存在的问题呢?这个绝对是有诀窍的,应用理论和实践相结合的方式才是解决问题最快速的方法。本期特邀长期从事蛋白组学研究的张剑博士、代谢组学专家马晨菲、资深蛋白生信专家戴文韬以及培训学员500多人的资深生信讲师等……

 

戴文韬:博士,上海药物转化工程技术研究中心生物信息主管,上海生物信息技术研究中心助理研究员,在多组学数据整合分析方面,参与发展了差异化调控网络分析方法,在PDX技术领域,作为国内规模最大的公益性PDX模型库数据平台负责人。设计并初步开发了平台配套的包括PDX生物样本资源、临床信息和组学遗传信息存储分析等数据链条高度整合的一体化MEDPDX信息化系统。

张剑:鹿明生物资深技术支持,长期从事质谱与蛋白质组学研究,申请获批多项发明专利,参与过数个国内科研项目。

马晨菲:博士,鹿明生物技术支持,2009年毕业于中国科学院大连化学物理研究所代谢组学研究中心,师从许国旺研究员,是国内最早开展代谢组学的研究人员之一。国内第一本代谢组学著作《代谢组学—方法与应用》(ISBN:9787030215284)合著者之一,并参加植物代谢组学著作《植物代谢组学—方法与应用》(2011,ISBN97871225875)的编写。

讲师团队还有鹿明生物资深生信工程师、培训学员500+的资深讲师手把手教您实操。

报名方式

(长按二维码填写报名表或者Call:17317724501)

 

时间

2019年8月22日至8月23日

地点

北京,具体地点待定

注册费

2000元/人

 

 

 

 

现推出支付定金99元即可抢占培训名额,且付款前5名享受培训费9折特惠活动。

 

规则:1、支付99元定金,抢占培训班报名名额;预定人数较多时,按照培训费付款先后顺序确定前5名,以到账时间为准。

2、定金将于培训费款项到账后退回;如成功享受折扣,享受的折扣费用差价将于款项到账后的3-5个工作日退回。

3、为保证公平公正,定金享受折扣活动最终结果将会在公众号展示说明。

4、名额仅限前5名,赶紧抓住这波福利吧。

 

PS:

预定抢座支付定金请转支付宝账号:谭老师  18621336286。

培训费缴纳方式:

①对公转账

汇款至: 上海鹿明生物科技有限公司
账户号: 0382 7530 0400 2159 3
开户行: 中国农业银行股份有限公司上海慧创支行

②支付宝转账

支付宝账号:zhaocl@lumingbio.com

 

 

 

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