第29期蛋白组学DIA+PRM等多种技术培训实战

时间:2018年9月18日(周二)至9月21日(周五)

地点:上海市闵行区新骏环路138号3幢501

 

 

1、会议目的及意义

本次培训课程主要讲解蛋白组样品前处理及操作、iTRAQ/TMT标记及多重标记定量蛋白组学流程、蛋白质谱上机及下机数据检索、DIA/SWATH、PRM技术介绍及数据处理及功能分析、统计分析等,并且通过实际上机操作学习如何以文章为导向对蛋白质组实验数据进行分析与作图,结合实际案例,进行实战演练。特邀讲师均在蛋白质组学实验及生物信息分析方面拥有丰富科研项目经验的专家。希望通过理论讲解和实际操作演练,帮助学员解决当前难题,扩展研究思路,提升科研水平,快速发表更高水平的研究论文。

2、主办单位

上海鹿明生物科技有限公司

3、开班时间

2018年9月18日(周二)至9月21日(周四)
4、开班地点

上海市闵行区新骏环路138号3幢501(鹿明生物中心会议室)

5、注册费用

注册费:4000元/人

团报优惠活动:2人以上打九折(3600元),3人打八折(3200元),3人以上打七折(2800元) 

活动说明:9月10日前均可享受团报活动,逾期不享受活动价格。

备注:
①注册费包括培训费、资料费、4天的午餐费
② 9月17日报名截止,汇款学员视收到汇款凭证(截图、扫描件)为成功报名
③学员需自备笔记本电脑,具体课程安排以开班当天课程表为准
④ 交通、住宿费用自理(但可享受鹿明生物与附近酒店合作的优惠价)

⑤4天培训期的早、晚餐费用自理。

6、付款方式
①对公转账

汇款至: 上海鹿明生物科技有限公司
账户号: 0382 7530 0400 2159 3
开户行: 中国农业银行股份有限公司上海慧创支行

②支付宝转账

转账至:谭琼

支付宝账号:18621336286

备注:转账或汇款时仔细核对账户名称及账号,汇款时请务必注明学员姓名、单位。汇款后将汇款凭据(截图或扫描电子版发送至邮箱market@lumingbio.com,以确保汇款安全到账)

7、报名方式   

电脑端:

①电脑端登入www.lumingbio.com,单击培训讲座,点击在线报名,填写好表单并提交。

②报名链接:http://www.lumingbio.com/site/onlineRegistration

 

手机端:扫码填写报名表

 

(报名时请备注“参加9蛋白组学培训会议”)

8、联系方式
联系人:谭老师  
手机:17317724501(微信同号)

Q Q:1651593433
邮箱:market@lumingbio.com

9、培训会议课程安排

时间

授课题目

授课老师

授课内容

周二(9月18日)

8:30-9:00

报道,开班仪式

舒烈波

鹿明生物及本次培训班介绍

9:00-9:50

核酸组技术与应用

李纪勤

1, 基因组技术

2, 转录组技术

3, 蛋白互作酵母文库技术

10:00-10:30

基于质谱的蛋白组技术与应用

徐燕

1, 标记定量蛋白组技术

2, 非标记定量蛋白组技术

3, 蛋白组技术应用

茶歇

10:50-11:20

代谢组技术与应用

温馨

1, GC-MS代谢组技术

2, LC-MS代谢组技术

3, 代谢组技术应用

11:20-11:30合影,11:30-12:00午餐

13:30-14:00

蛋白组前处理技术讲解

徐燕

1, 蛋白组样品制备技术

2, 样品酶解及标记技术

14:00-17:00

蛋白前处理操作

徐燕-王方娜

1, 蛋白提取

2, 蛋白浓度测定

3, SDS-PAGE凝胶电泳测定(根据实际情况选择是否要进行实践操作)

周三(9月19日)

9:00-10:00

iTRAQ/TMT标记

徐燕-沈珈西

1,蛋白酶解(过夜)(冷冻干燥过程模拟一下,时间略过)

2, iTRAQ/TMT标记(冷冻干燥过程及时间均略过)

10:00-10:40

多重标记定量蛋白质组学流程

陈晨

1, 多重标记定量蛋白质技术原理

2, 多重标记定量蛋白组流程及应用

茶歇

11:00-11:30

标记后样品分离

张岩

标记后样品分离(冷冻干燥过程及时间均略过)

11:30-12:00午餐

13:30-15:30

质谱上机与维护

侯娟

1,质谱上机

2,日常维护

15:30-17:00

质谱下机数据检索

侯娟

1,质谱数据分析软件介绍

2,数据检索及实际操作

周四(9月20日)

9:00-9:30

DIA/SWATH、PRM技术介绍

郭天南

DIA/SWATH、PRM新技术介绍及应用

9:30-10:00

PCT-SWATH技术介绍

孙耀庭

PCT-SWATH技术介绍

10:00-10:40

PRM质谱上机(DDA)

徐燕-张岩

流程介绍及起始流程确认-上机实践

茶歇

11:00-11:30

PRM-DDA数据搜库(PD)

张岩

DDA数据搜库

11:30-12:00午餐

13:30-14:00

PRM数据处理1

徐燕

基于DDA数据建库(Skyline)及目标肽段筛选

14:00-14:30

PRM上机

徐燕-张岩

PRM靶向样品上机实践

14:30-15:30

PRM数据处理2

徐燕

PRM数据检索(Skyline)及结果查看分析

15:30-17:00

DIA数据处理

朱天生

1, 基于DDA数据建库(Maxquant、Spectrast、Openms)

2, DIA/SWATH数据检索(Open-SWATH)

3, DIA/SWATH数据查看与分析

周五(9月21日)

9:00-10:00

蛋白组差异数据筛选及实践操作

丁山

1, 不同实验设计方案的蛋白质组数据差异蛋白筛选方法;

2, 差异蛋白筛选实战演练

茶歇

10:20-11:30

常规统计分析作图

丁山

1, 维恩分析

2, 层次聚类作图

3, 热图聚类作图

11:30-12:00午餐

13:30-15:00

基于权威数据库的功能分析与实战演练

戴文韬

1, Gene Ontology功能介绍及操作展示

2, 基于DAVID数据库进行GO功能富集分析

3, KEGG通路数据库功能介绍及操作展示

4, String蛋白互作数据库功能介绍及操作展示

15:00-16:30

多层组学整合

陈敏

转录组、蛋白组、代谢组关联分析

16:30-17:00

答疑

部分老师

 

 

 

10、讲师介绍

郭天南:西湖高等研究院任特聘研究员;2006年毕业于华中科技大学同济医学院临床医学七年制,同时获得武汉大学生物科学双学位。2007-2008年在新加坡国立肿瘤中心从事医学研究工作。2012年获得新加坡南洋理工大学博士学位(导师Newman Sze和Oi Lian Kon)。2012-2017在瑞士苏黎世联邦理工大学Ruedi Aebersold教授实验室从事博士后研究。2017年初至七月在澳大利亚悉尼大学儿童医学研究所ProCan任Scientific Director,肿瘤蛋白质组Group Leader,悉尼大学医学院兼聘高级讲师。2017年8月加入西湖高等研究院任特聘研究员,建立高通量临床蛋白质组学实验室。

 

戴文韬:博士,上海药物转化工程技术研究中心生物信息主管,上海生物信息技术研究中心助理研究员,在多组学数据整合分析方面,参与发展了差异化调控网络分析方法,在PDX技术领域,作为国内规模最大的公益性PDX模型库数据平台负责人。设计并初步开发了平台配套的包括PDX生物样本资源、临床信息和组学遗传信息存储分析等数据链条高度整合的一体化MEDPDX信息化系统。

 

孙耀庭:西湖大学二期博士研究生,研究方向是肿瘤多药耐药,目前主要从事于临床样本高通量蛋白质组学研究。擅长蛋白质组学实验设计、各种类型的样品制备、质谱分析。

 

朱天生:浙江西湖高等研究院基础医学研究所资深研究助理,具备生物学和计算机双重专业背景,Oracle数据库认证专家,拥有多项发明专利,参与过数个国际、国内科学研究项目,现从事蛋白质组学数据平台管理和数据科学研究。

 

舒烈波:博士,鹿明生物技术总监,协助科研人员在MCP、Proteomics、Metabolomics等几乎所有主要蛋白质组及代谢组领域杂志发表研究论文百余篇,在蛋白质组及代谢组实验设计、技术以及相应的数据整理分析和论文投稿方面有较丰富的经验。

李纪勤:博士,毕业于中国海洋大学,欧易生物技术支持部经理,主要负责实验课题方案设计以及项目实施,特别是高通量测序相关项目,在基因组、转录组实验技术及方案设计方面有丰富经验。

陈  敏:鹿明生物蛋白分析项目组负责人,“组学金豆”系统(OmicsBean)及“生物猫“(BioMoa)系统开发与应用专家,专注于转录组、蛋白组和代谢组数据处理及生物信息学分析,在数据分析及结果解释方面经验丰富。

 :鹿明生物蛋白组组长,上海交通大学系统生物医学研究院2015级硕士研究生,研究方向疾病蛋白质组学,学位论文为脓毒症血浆外泌体的分离提纯及其蛋白质组研究,并以第一作者在Biochemical and biophysical research communications上发表SCI论文一篇。目前,在本公司担任蛋白部实验组组长,负责样本前处理、质谱鉴定以及项目报告的整理。

温馨:鹿明生物代谢部主管,硕士毕业于浙江大学农业与生物技术学院,负责代谢组学实验及数据分析,在代谢组学实验设计,样品前处理,上机及下机数据分析方面有丰富经验

 

侯娟:鹿明生物蛋白质谱项目组负责人,主要负责蛋白的质谱检测,在以QE为代表的蛋白质质谱的仪器操作及数据检索方面有丰富经验。

张岩:鹿明生物蛋白组质谱实验员,有多年的液质联用的应用与维护经验,在本公司负责液相色谱及QE方法开发等工作,致力于质谱仪的各种蛋白组学检测及应用。

丁山:鹿明生物生信分析高级工程师,主要负责蛋白组数据的各种生信分析,在R语言绘图方面有丰富的经验。

11、酒店安排

①上海新奇士国际酒店    距离鹿明生物600m

新奇士国际酒店

房型

酒店门市价

协议优惠价

酒店总机:021-64299880

豪华套房

688元/间

350元/间

地址:上海市闵行区浦江镇三鲁路3585号

豪华双人房

688元/间

350元/间

标准双人间

588元/间

260元/间

注:此协议房价含双人早餐

豪华大床房

488元/间

238元/间

 

②维也纳国际酒店(上海浦江店)  距离鹿明生物2.5km

维也纳国际酒店(上海浦江店)

房型

酒店门市价

协议优惠价

酒店总机:021-34788018

标准大床/双床

398元/间

294元/间

豪华大床/双床

428元/间

318元/间

地址:上海市闵行区浦江镇昌林路128号

商务大床

459元/间

334元/间

行政双床

528元/间

390元/间

注:上述房间协议价均赠早餐

豪华套房

648元/间

486元/间

 

12、交通路线

①上海站 ←→ 鹿明生物会议中心

  •  推荐路线: 上海站下车后搭乘地铁 1 号线到人民广场站(3站),站内换乘8号线到江月路站(13站), 在江月路站1号口出,搭乘796路公交到江月路三鲁路站下车(2站),步行直走363米即可到达鹿明生物会议中心。(即:地铁1号线——地铁8号线——796路公交) 乘车时间约 1小时10分钟。

②上海南站 ←→ 鹿明生物会议中心

  •  推荐路线: 上海南站下车后搭乘地铁1号线到徐家汇站(3站),站内换乘11号线到东方体育中心站(5站),站内换乘8号线到江月路站(4站),江月路站1号口出,搭乘796路公交到江月路三鲁路站下车(2站),步行直走363米即可达到鹿明生物会议中心。(即:地铁1号线——地铁11号线——地铁8号线——796路公交) 乘车时间约1小时8分钟。

③上海虹桥站/虹桥机场 ←→ 鹿明生物会议中心

  •  推荐路线:虹桥火车站/虹桥机场下车后搭乘地铁10号线到交通大学站(9站/7站),站内换乘11号线到东方体育中心站(6站),站内换乘8号线到江月路站(4站),江月路站1号口出搭乘796路公交到江月路三鲁路站下车(2站),步行直走363米即可到达鹿明生物会议中心。(即:地铁10号线——地铁11号线——地铁8号线——796路公交) 乘车时间约1小时10分钟。

④浦东国际机场 ←→ 鹿明生物会议中心

  •  推荐路线:下车后搭乘地铁2号线东延伸段到广兰路站(8站),站内换乘地铁2号线到龙阳路站(3站),站内换乘地铁7号线到耀华路站(6站),站内换乘8号线到江月路站(7站),在江月路站1号口出,搭乘796路公交到江月路三鲁路下车(2站),步行直走363米即可到达鹿明生物会议中心。(即:地铁2号线东延伸段——地铁2号线——地铁7号线——地铁8号线——796路公交)  乘车时间约1小时50分钟。