修饰蛋白质组学
Modified proteomics
产品介绍
The service content
  • 磷酸化修饰
  • 乙酰化修饰
  • 泛素化修饰
实例分析

通过乙酰化修饰组分析鉴定玉米中真菌诱导的蛋白质超乙酰化现象

基本信息
材料:玉米组织                                                                                 主要技术:iTRAQ、乙酰化蛋白组
期刊    PNAS                                                                                    影响因子:9.504

 

文章摘要
赖氨酸乙酰化作为一种关键的翻译后修饰参与调节一系列生物学过程。组蛋白乙酰化在植物防御中发挥了重要作用,已知编码乙酰转移酶的病原效应蛋白可以直接乙酰化宿主蛋白从而改变宿主免疫力。然而,目前还未知内源性植物酶在免疫应答过程中是否可以调节蛋白乙酰化。本篇文章中研究团队调查效应分子HC-毒素(HCT),真菌病原菌Cochliobolus carbonum家族的组蛋白脱乙酰酶抑制剂如何通过改变蛋白质乙酰化促进玉米感染效应。通过蛋白质谱方法法团队全面量化了3,636种蛋白质的丰度与HCT处理的玉米植物中2,791个位点的乙酰化水平。这些数据的分析表明,乙酰化是一种广泛的翻译后修饰且影响众多的玉米基因编码的蛋白质。此外, HCT的应用能够证明植物编码的酶(组蛋白脱乙酰酶)的活性可以被调节以改变免疫应答过程中非组蛋白的乙酰化。因此,数据结果为进一步的通过可逆乙酰化对蛋白质功能的调节,并探究由炭疽杆菌触发的复杂免疫反应提供了研究基础。

 

方法流程

 

小鹿点评
本文是修饰蛋白质组学研究的一个典型案例。不同于常规修饰蛋白质组学的研究文章着重于对位点/肽段水平的修饰进行鉴定,本篇文章在常规肽段富集技术的基础上引入了iTRAQ标记定量蛋白组技术,从而在肽段水平实现了修饰定量,为在不同处理条件下乙酰修饰组的定量比较奠定了研究基础。

 

文献来源
Justin W. Walley. et al., Fungal-induced protein hyperacetylation in maize identified by acetylome profiling. 2017. PNAS.