LC-MS/MS脂质拟靶向代谢组检测


拟靶向脂质代谢组学

 

我们通过文献调研及目前脂质常用的数据库“脂质代谢物和代谢途径研究策略”(Lipid metabolites and pathways strategy,Lipid MAPS)及加州大学戴维斯分校脂质计算数据库(LipidBlast)和一些商业标准品开发了一种基于三重四极杆质谱的高通量定量脂质组学方法包。本方法包一共包含固醇脂类(Sterol Lipids,STs)、脂肪酰类(Fatty acyls,FAs)、甘油磷脂类(Glycerophospholipids,GPs)、甘油酯类(Glycerolipids,GLs)、鞘脂类(Sphingolipids,SPs)等5大类,30亚类脂类物质,共计1000种脂类物质,并通过74种同位素内标对不同类别脂质进行定量分析。本方法灵敏度高,且方法稳定可靠,能同时覆盖高丰度及低丰度的脂类物质检测,满足人、动植物体液、组织、细胞等各种不同类型样本的检测需求。



  

技术原理

 

数据处理通过由RIKEN Center for Sustainable Resource Science的Hiroshi Tsugawa团队发布的一款针对代谢组学数据管理和统计分析的开源软件MRMPROBS进行峰提取、峰对齐、峰鉴定、峰面积积分等自动化批处理,并辅助人工校正,导出的定性定量表格通过响应因子法进行定量分析。将代谢物的积分峰面积带入计算公式计算后,最终得到实际样本中各代谢物的半定量数据。

定量公式如下:

脂质含量(ng/mL或g)= A1 / A2 * C * V / N

A1 :目标脂质峰面积;

A2 :目标脂质对应的脂质内标峰面积;

C :样本中加入对应脂质内标的内标浓度值(ng/mL);

V :定容体积(0.2mL);

N :称取的样本质量或取样体积。




  

技术流程

 

拟靶向脂质代谢组学



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