蛋白组学


  

蛋白组学

 

定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)是蛋白质组学研究领域重要的应用之一。通过定量蛋白质组学技术,可以对样本中表达的全部蛋白质进行鉴定和定量,筛选样本或分组之间差异表达蛋白质,结合生物信息分析预测差异蛋白质功能,解析生理病理机制。基于质谱检测技术的定量蛋白质组学技术根据是否加标记可以分为两大类:非标定量技术,包括Label-free和DIA,标记定量技术,包括TMT和iTRAQ。


定量蛋白质组技术根据数据采集模式分为数据依赖性的扫描模式(Data-dependent acquisition, DDA)和数据非依赖性的扫描模式(Data-independent acquisition, DIA)。Label-free,TMT/iTRAQ 采用的都是DDA模式。


同时,鹿明生物引入了布鲁克tims TOF pro,并引入了与其高MSMS扫描速度匹配的Evosep One 高通量色谱,打造捕获离子淌度的4D蛋白质组学分析体系。由于离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。4D-Proteomics™是在3D分离即保留时间(Retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(Intensity)这三个维度的基础之上增加了第四个维度,离子淌度(Mobility)的分离(图1),进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的提升。

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