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tims TOF Pro—新一代4D蛋白质组学

一手消息,鹿明生物的仪器家族成员继Sciex QTRAP 6500 plus、Thermo ScientificTSQ Altis、Thermo Scientific Q Exactive HF之后,又迎来了新成员——布鲁克tims TOF Pro,并引入了与此配备的Evosep One 高通量色谱,打造捕获离子淌度的4D蛋白质组学分析体系。
 

同时,小鹿也为各位看官整理了,tims TOF Pro是怎样飘洋过海,舟车劳顿来到鹿明大家族的?
 

德国出仓始发:布鲁克tims TOF Pro始发于德国
 

搬家,4步曲
 

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安装入驻,4步曲
 

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tims TOF Pro介绍篇
 

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由于离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。4D-Proteomics™是在3D分离即保留时间(Retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(Intensity)这三个维度的基础之上增加了第四个维度,离子淌度(Mobility)的分离(图1),进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的全面提升。
 

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图1 | 新一代4D-蛋白质组学示意图
 

tims TOF Pro捕集离子淌度飞行时间质谱通过离子淌度(ion mobility)分离后,利用四极杆进行快速扫描,再送入碰撞室CID碰撞后,到TOF中进行高分辨的MS/MS测定。在整个LC-MS/MS流程中,每秒可以获得100-150张高分辨的MS/MS谱,且可保持40,000-50,000高的分辨率,达到业界最高的水平。关于采集MS/MS图谱时,比较所有其它质谱,Q-TOF是可以获得20,000-50,000的高分辨MS/MS的质谱类型(Orbitrap在做shotgun蛋白质实验室,其MS/MS图谱通常只有7,500的分辨率),而tims TOF Pro不仅可以达到40,000-50,000的MS/MS分辨率,而且可以达到业界最快的每秒100-150次MS/MS的采集速度(Orbitrap的最快MS/MS速度为每秒40次MS/MS)。
 

tims TOF Pro特点:
 

*更灵敏
 

由于timsTOF Pro有更快的采集速度,在有些情况下,有些离子可以扫描多次,从而累积离子,获得更高的灵敏度,若以平均每个母离子扫描3次计,这就使得灵敏度提高了3倍。为用户带来的好处是:首先可以鉴定到更低丰度的蛋白,其次可以使用更少的样品。
 

*定量更准确
 

在蛋白质组学研究中,一个关键的步骤就是对不同生物学重复样本之间蛋白丰度进行准确定量,即所谓的“质控标准”。为了进一步分析timsTOF Pro对蛋白定量的准确性,研究者从皮尔森相关系数(Pearson correlation coefficient)、中位数变异系数(median coefficients of variation)、缺失值(missing value)和定量准确度(quantitative accuracy)这四个统计角度进行分析。在2h、四次重复的条件下平均鉴定到5575个蛋白,重复性分析结果显示皮尔森相关系数为0.979,表明实验的重复性非常好。MaxLFQ归一化以后,中位数变异系数为7.2%。
 

*鉴定出更多的蛋白质
 

更快、更灵敏,在鸟枪法蛋白质组学中,最终带来的结果是,可以在一次实验中,鉴定更多的蛋白质。比如,在200ng HeLa Digest(人宫颈癌细胞酶解物)样品中,可以通过90分钟的LC-MS实验,鉴定5,200多个蛋白质,达到业界最高的水平。
 

使tims TOF Pro成为科学家们的得力工具。可帮助他们对复杂样品的分子机制进行更深入的研究、提高发现低丰度生物学重要蛋白质的可能性;在转化医学、临床蛋白质组学研究中进行大批量验证和纵向研究。
 

tims TOF Pro产品快报
4D组学新时代!引领高通量蛋白质组学

 

蛋白质组学不仅仅是寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一,而且在对癌症、老年痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面也有十分诱人的前景。高通量蛋白组学则成为了生物医学基础研究和应用开发的重要前沿和突破口,而如何实现对大队列样本稳定可靠地分析也逐渐成为了科研热点和难点。
 

鹿明生物针对tims TOF Pro仪器推出以下产品助力各位老师的4D高通量蛋白质组学研究:
 

4D-DIA大样本群组医学研究:timsTOF Pro可显著提高临床样本中的蛋白定量数目和检测效率。对蛋白鉴定的深度覆盖和快速检测,促进生物标志物的发现与分析分型,为分析数百到数千个样本的大样本群组提供了全新的可能。英国牛津大学研究这用收集的192例血浆样本去除高丰度蛋白后,酶切肽段在timsTOF Pro与Evosep液相平台上使用11.5分钟梯度(对应每天近100例样品的分析)分析,样本测试中插入20针QC样本进行质控,总计212个样本仅需51小时即可全部完成测试(图2A),这项工作采用传统的质谱方案可能需要接近10天的时间。
 

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图2 | Roman Fischer博士血液蛋白组研究高效、快速的大样本群检测方案
 

微量样本蛋白组学(4D-PCT-DIA)运用:timsTOF Pro凭借杰出的检测灵敏度,能从较小样品量中获得突出的鉴定效果,为数量有限的待分析细胞如干细胞、免疫细胞等或亚细胞结构(微量样品)等提供了更可靠的数据结果。
 

高通量修饰组学分析:tims TOF Pro独有的非标定量方法结合了短LC梯度和4D匹配的高选择性,带来了高的数据采集速读、灵敏度和分辨率,可以用更低的进样量来鉴定到更多的多肽和PTMs,尤其适合复杂PTMs的鉴定和定位。
 

欢迎各位老师直接致电鹿明生物当地销售工程师或访问鹿明生物官网了解详情~
 

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文章来源于鹿明生物

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