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年度盘点 | 植物方向蛋白组学/代谢组学TOP项目文章大锦集

编者按:

 

距离2021年的跨年时刻还有3天的工作日,此时的你是正在忙着立明年的Flag?绞尽脑汁地准备明年的国自然基金申请?还是正在踌躇明年的课题文章该投稿哪家?

此刻,小鹿要告诉您:只有对本年有明确地认知和总结,我们才能更好地备战明年。本篇小鹿盘点了今年欧易/鹿明生物经典客户文章运用,植物方向年度TOP10影响因子发文情况,总计影响因子:84.399;


TOP1
 

tRNA硫醇化途径关键基因SLG1在水稻抵抗高温胁迫中的机制研究
 

英文标题:Natural variations of SLG1 confer high-temperature tolerance in indica rice

研究对象:水稻

发表期刊:Nature Communications

影响因子:12.121

发表时间:2020年10月30日

合作单位:中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因组学国家重点实验室

主要运用欧易/鹿明生物技术:LC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)、酵母文库
 

上海鹿明生物科技有限公司


本文运用酵母文库及iTRAQ蛋白质组学发现了tRNA硫醇化途径中的关键基因SLG1在水稻抵抗高温胁迫中的重要功能。并为应对全球变暖、设计培育高温胁迫耐受性水稻品种提供有效策略。


TOP2
 

植物根际微生物对开花时间影响的研究
 

英文标题:Rhizosphere microorganisms can influence the timing of plant flowering

研究对象:野生型和突变型拟南芥根系分泌物、根际土壤

发表期刊:Microbiome

影响因子:11.607

合作单位:浙江工业大学环境学院

主要运用欧易/鹿明生物技术:GC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)、16S rRNA基因测序
 

上海鹿明生物科技有限公司


本文通过整合GC-MS非靶向代谢组学和转录组测序数据,发现根际微生物群对植物关键功能的调控发挥重要作用,揭示了拟南芥根部微生物将色氨酸转化为植物激素吲哚乙酸从而延迟开花的代谢调控网络和作用机制。


TOP3
 

紫薯中铀和镉吸收及其相互作用机理
 

英文标题:Absorption and interaction mechanisms of uranium & cadmium in purplesweet potato(Ipomoea batatas L.)

研究对象:紫薯幼苗

发表期刊:Journal of Hazardous MaterialsJournal of Hazardous Materials

影响因子:9.038

合作单位:西南科技大学环境与资源学院

主要运用欧易/鹿明生物技术:LC-MS非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)
 

上海鹿明生物科技有限公司


作为西南科技大学发表的第三篇植物重金属胁迫的研究文章,本文依旧亮点满满。作为重要的非生物胁迫,重金属暴露的相关文献多使用单一元素,而这篇文章增加了铀+镉双重因素的考察。元素分析与非靶向代谢组学分析结果相辅相成,共同阐述了铀和镉胁迫对矿物质代谢和初生\次生代谢产生的影响,通过周密的实验设计,详细地阐述了紫薯应对铀和镉暴露相同和不同的代谢应答机制。


TOP4
 

蚕豆光合作用和呼吸代谢组对铀暴露的响应机制
 

英文标题:Unraveling response mechanism of photosynthetic metabolism and respiratory metabolism to uranium-exposure in Vicia faba

研究对象:蚕豆

发表期刊:Journal of Hazardous Materials

影响因子:9.038

合作单位:西南科技大学环境与资源学院

主要运用欧易/鹿明生物技术:GC-MS非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学 (由欧易生物提供技术支持)
 

上海鹿明生物科技有限公司


本文通过通过转录组学和GC-MS非靶向代谢组学结合植物生理参数分析等研究手段,发现放射性元素铀对植物生长和根系微观结构的影响,深入而透彻地阐明了铀暴露对植物光合碳代谢和呼吸代谢的毒性机制。作者虽使用了同一组转录和代谢数据,但本文中蚕豆幼苗对铀毒性的响应机制研究更加深入,并与生理表型检测结果相互对应,其严谨的实验思路和深入地研究结果,值得借鉴和参考。


TOP5
 

甘蓝型油菜中两个新基因重塑新型相互作用网络
 

英文标题:Two Young Genes Reshape a Novel Interaction Network in Brassica napus

研究对象:甘蓝型油菜、拟南芥

发表期刊:New phytologist

影响因子:8.512

合作单位:华中农业大学

主要运用欧易/鹿明生物技术:iTRAQ定量蛋白质组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学
 

上海鹿明生物科技有限公司

本文作者运用iTRAQ定量蛋白质组学、转录组学研究筛选到甘蓝型油菜中Bnams4b和BnaMs3的相互作用蛋白,对两个种群特异性共同进化的年轻基因在植物中重塑了一个新型互作网络。


TOP6
 

银纳米颗粒改变种植和未种植黄瓜土壤中的微生物群落组成和代谢物谱
 

英文标题:Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil

研究对象:种植和未种植的黄瓜土壤

发表期刊:Environmental Science & Technology

影响因子:7.864

合作单位:南京大学环境学院

主要运用欧易/鹿明生物技术:GC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)、16S rRNA基因测序
 

上海鹿明生物科技有限公司


该研究运用16S rRNA基因测序、GC-MS非靶向代谢组技术对土壤微生物组和代谢组学分析技术的独特结合,提供了对AgNPs生态影响的全新视角,全面了解了AgNPs暴露对土壤微生物的影响。


TOP7
 

代谢组学揭示暴露于CeO2纳米颗粒的菠菜植物的“隐形”响应
 

英文标题:Metabolomics Reveal the “Invisible” Responses of Spinach Plants Exposed to CeO2 Nanoparticles

研究对象:菠菜叶片和根

发表期刊:Environmental Science & Technology

影响因子:7.864

合作单位:南京大学环境学院污染控制与资源再利用国家重点实验室

主要运用欧易/鹿明生物技术:GC-MS非靶向代谢组(由鹿明生物提供技术支持)
 

上海鹿明生物科技有限公司


本文通过通过整合表型和代谢组学分析,研究了氧化铈纳米粒与菠菜之间的相互作用。发现在表型特征没有变化的情况下,不同剂量的CeO2 NPs均可诱导叶和根的代谢重构,同时叶与根中的微量金属元素含量下降,这篇文章的结果有助于更好地理解植物的内在表型和代谢组变化。
 

TOP8
 

iTRAQ标记定量蛋白质组分析揭示硝普钠处理对大豆芽的影响
 

英文标题:iTRAQ-based proteomic analysis reveals changes in response to sodium nitroprusside treatment in soybean sprouts

研究对象:大豆芽

发表期刊:Food Chemistry

影响因子:6.306

合作单位:南京农业大学

主要运用欧易/鹿明生物技术:iTRAQ标记定量蛋白质组学(由鹿明生物提供技术支持)
 

上海鹿明生物科技有限公司


通过iTRAQ标记定量蛋白质组学发现硝普钠(NO供体)处理调节参与抗氧化系统和脂质过氧化相关蛋白质的表达,为生产有益于人体健康的功能性食品提供理论指导。研究中iTRAQ标记定量蛋白质组学实验由鹿明生物提供技术支持。
 

TOP9
 

耐寒性的影响因素——田间和人工冷驯化越冬常绿植物的转录组学比较研究
 

英文标题:Factors affecting freezing tolerance: a comparative transcriptomics study between field and artificial cold acclimations in overwintering evergreens

研究对象:植物叶片

发表期刊:The Plant Journal

影响因子:6.141

合作单位:浙江大学

主要运用欧易/鹿明生物技术:靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组
 

上海鹿明生物科技有限公司


该研究通过靶向代谢组学和转录组学技术对比常绿杜鹃花在自然冷驯化和人工冷驯化处理的植物激素水平和转录水平的异同,发现花青素在冷驯化过程中的重要作用,深入而透彻地阐明了常绿乔木的耐寒性分子机制。


TOP10
 

甲硫氨酸合酶1为激活AtGLR3.5Ca2+通道和调节拟南芥种子萌发提供甲硫氨酸
 

英文标题:Methionine Synthase 1 Provides Methionine for Activating AtGLR3.5 Ca2+ Channel and Regulating Germination in Arabidopsis

研究对象:拟南芥

发表期刊:Journal of Experimental Botany

影响因子:5.908

合作单位:首都师范大学

主要运用欧易/鹿明生物技术:GC-MS非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)
 

上海鹿明生物科技有限公司


通过GC-MS靶向代谢组学证明了L-Met通过上调AtGLR3.5介导的细胞溶质Ca2+信号促进拟南芥种子萌发。作者的研究结果与AtMS1、L-Met、AtGLR3.5Ca2+通道、Ca2+信号和ABI4有关,揭示了L-Met在种子萌发中的生理作用和分子机制。
 

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END

文章来源于鹿明生物

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